Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EdaO54693 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EdaO54693 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EdaO54693 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EdaO54693 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms