Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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