Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Opn1mwO35599 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms