Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clk4O35493 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clk4O35493 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk4O35493 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk4O35493 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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