Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1dO35473 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1dO35473 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1dO35473 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1dO35473 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1dO35473 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1dO35473 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1dO35473 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1dO35473 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1dO35473 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1dO35473 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1dO35473 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1dO35473 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1dO35473 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms