Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc1O35379 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc1O35379 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc1O35379 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc1O35379 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc1O35379 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
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