Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptpn9O35239 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Ptpn9O35239 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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