Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Nedd9O35177 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd9O35177 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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