Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pitx3O35160 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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