Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif1cO35071 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif1cO35071 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms