Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PbsnO08976 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PbsnO08976 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PbsnO08976 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PbsnO08976 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PbsnO08976 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms