Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema3aO08665 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sema3aO08665 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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