Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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U90926O08546 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
U90926O08546 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
U90926O08546 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
U90926O08546 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
U90926O08546 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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U90926O08546 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
U90926O08546 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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