Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm21310J3QQ23 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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