Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkal1J3QPP8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkal1J3QPP8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms