Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm2035J3QP87 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm2035J3QP87 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm2035J3QP87 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2035J3QP87 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm2035J3QP87 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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