Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5294J3QP53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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