Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm20918J3QN17 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20918J3QN17 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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