Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lipo1J3QME6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lipo1J3QME6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lipo1J3QME6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms