Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20828J3KMI7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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