Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20696H3BJN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms