Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm29394H3BIW7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29394H3BIW7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms