Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Taf4bG5E8Z2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf4bG5E8Z2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms