Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pabpc4lG5E8X2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms