Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r12G5E8G1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms