Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r167G3UW71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r167G3UW71 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms