Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm5160F8VPN3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm5160F8VPN3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm5160F8VPN3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms