Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm28038F7BCN9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm28038F7BCN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm28038F7BCN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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