Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28048F7BCN0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms