Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmgcF6VRN1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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