Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm340F6RGI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms