Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Herc6F2Z461 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms