Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms