Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh16f1E9Q9P8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms