Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm5407E9Q7Q1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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