Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf169E9Q7F2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms