Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC030500E9Q6W0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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