Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtproE9Q612 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtproE9Q612 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms