Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71lE9Q4T4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms