Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ApobE9Q414 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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