Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ccdc171E9Q1U1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc171E9Q1U1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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