Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myo5cE9Q1F5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Myo5cE9Q1F5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms