Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930426L09RikE9Q0N7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930426L09RikE9Q0N7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms