Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gcom1E9PZ54 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcom1E9PZ54 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms