Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp4E9PYK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp4E9PYK3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms