Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sfta2E9PXB6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sfta2E9PXB6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms