Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3lE9PWZ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms