Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms