Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim30bE9PVL6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim30bE9PVL6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms