Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clca3bE9PUL3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms